Berikut ini tautan animasi untuk pembelajaran kimia. Dikumpulkan dari berbagai sumber. Format file adalah SWF, format ini memang sudah tidak didukung oleh browser kebanyakan, namun masih dapat dibuka dengan menggunakan aplikasi SWF Opener atau yang sejenis. Lanjutkan membaca “Daftar Animasi Kimia untuk SMA/MA/SMK”
Uji Coba Muat Jsmol
Hasil penampilan Jmol di wordpress.
Kode yang digunakan:
<script type="text/javascript" src="jmol/jsmol/JSmol.min.js"></script>
<script type="text/javascript">
var Info41 = {
width: 320,
height: 320,
debug: false,
color: "0xffffff",
addSelectionOptions: false,
serverURL: "jmol/jsmol/php/jsmol.php",
use: "HTML5",
j2sPath: "jmol/jsmol/j2s",
disableJ2SLoadMonitor: true,
disableInitialConsole: true,
allowJavaScript: true,
script: "load http://urip.blogchem.com/FileMolCool/CHCl3-2.mol; frank off; set antialiasdisplay true; zoom 180; move 0 90 0 0 0 0 0 0 1; measure allconnected (*)(*); set measurementUnits 'PM'; set echo bottom center; color echo green; font echo 12 bold;; echo Dibuat oleh urip.info;",}
</script>
Hasil penampilan Jmol di wordpress.
<script type="text/javascript">Jmol.getApplet("Jmol41", Info41);</script>
Data Visual untuk Pengajaran Kimia
Berikut ini adalah data yang diunggah kembali dari CoolMolekul Stolaf dot edu untuk digunakan untuk pengajaran kimia baik di MA/SMA/SMK maupun di jenjang lebih tinggi. Lanjutkan membaca “Data Visual untuk Pengajaran Kimia”
Data file molekul *.log gaussian untuk penampil MO Jmol
Berikut ini adalah kumpulan berkas *.log yang diambil dari vchem3d dot univ-tlse3 dot fr. Berkas berikut dapat dijadikan contoh untuk visualisasi orbital molekul pada Jmol maupun untuk software kimia lainnya. Mari gunakan secara bijak untuk kebutuhan pembelajaran kimia di Indonesia.
- acetic-acid-mos.log
- acetone-mos.log
- allene-mos.log
- ammoniac-mos.log
- benzoquinone-mos.log
- chloroethane-mos.log
- co-mos.log
- cpmoins-mos.log
- cyclopentadienone-mos.log
- dimethylamine-mos.log
- e-butadiene-mos.log
- ethane-decale-mos.log
- ethyne-mos.log
- furan-mos.log
- h2o-mos.log
- hexatriene-mos.log
- hf-mos.log
- imine-mos.log
- maleic-anhydride-mos.log
- methane-mos.log
- methanol-mos.log
- pyridine-mos.log
- pyrimidine-mos.log
- pyrrole-mos.log
- rgrignard-mos.log
- z-butadiene-mos.log
Data molekul untuk Jmol yang dapat digunakan
Berikut ini data molekul yang biasa digunakan sebagai contoh simulasi Jmol. Dapat diunduh untuk digunakan secara daring maupun luring.
- 04182.cif
- 04210d.cif
- 04369a.cif
- 10x10pmesh.txt
- 114d.cif
- 1a3n.pdb
- 1ADE.cif
- 1AL4.pdb
- 1B2K.cif
- 1bkx.pdb
- 1BLC.cif
- 1blu.pdb
- 1bna.pdb
- 1cdr.pdb
- 1CRC.cif
- 1crn-molecular.jvxl
- 1crn-solvent.jvxl
- 1crn.jvxl
- 1crn.mol2
- 1crn.pdb
- 1crnnav.pdb
- 1crntest.pdb
- 1d01.pdb
- 1d66.pdb
- 1dry-mep.jvxl
- 1dry.pdb
- 1ECN.cif
- 1HF4.cif
- 1hje.cif
- 1hje.pdb
- 1JGQ.pdb
- 1LDN.cif
- 1LIN.cif
- 1lmb.efvet.gz
- 1lmb.pdb
- 1mbo.cif
- 1mng.cif
- 1MYG.cif
- 1myg_2.cif
- 1p84.cif
- 1PHA.cif
- 1PHB.cif
- 1qys.pdb
- 1sva.pdb
- 1VIF.cif
- 1VWH.cif
- 1VWP.cif
- 1w2i.xml
- 1w2i_xplor.png
- 1XIS.cif
- 1XY1.cif
- 1XY2.cif
- 1zir.cif
- 2-ClBu.mol
- 2-ClBu.spt
- 2BY9.pdb
- 2by9_2.pdb
- 2LHB.cif
- 2ptn-molecular_slice1.jvxl
- 2ptn-molecular_slice2.jvxl
- 2ptn-molecular_slice3.jvxl
- 2ptn.cif
- 2qnh.pdb.gz
- 2TBV.cif
- 3cc2_900-1100.pdb
- 3CC2_HmKt38.pdb
- 3CC2_HmKt7.pdb
- 3cc2_Kt7.pdb
- 3dna.alc
- 3hyd.pdb
- 3hyd_map.ccp4
- 3hyd_map.ccp4.gz
- 3ovo.cif
- 4DFR.cif
- 5BIR.cif
- 5hvp.cif
- acetic%20acid.spartan
- acetic_acid.gamess
- aceticacid_nbo.log
- acetone.csf
- adenine.alc
- AgFUPMOS.cif
- ala_5_180_0.pdb
- Andalusite.struct
- asp.mol2
- aspirin.alc
- benzene-homo.cub.gz
- benzene.xml
- benzenevib.spardir.html
- Bisphenol.xml
- blueshade.png
- bob1.png
- bob2.png
- bs.prmtop.gz
- bs_md1.coord.gz
- bs_md2.coord.gz
- bs_md3.coord.gz
- btnAnim.spt
- btnCartoon.spt
- btnCavity.spt
- btnSurface.spt
- buttons.spt
- c2h.xyz
- c2v.xyz
- c3h.xyz
- c5v.xyz
- c6.xyz
- c60.xyz
- c6h12.txt
- c6h12.xyz
- C6H6-mep.jvxl
- C6H6.smol
- c6hb.xyz
- c6v.xyz
- caffeine.jpg
- caffeine.pdf
- caffeine.xyz
- caffeine2.xyz
- caffeine_21_21_21.png
- caffeineDT.xyz
- calcite.cif
- calcVolume.txt
- castep.cell
- ch2o_homo.mo
- ch3cl-density.cub.gz
- ch3cl-esp.cub.gz
- ch3cl-solvent.jvxl
- ch3cl.cub
- ch3cl.jvxl
- ch3cl.mol
- ch3cl_map.jvxl
- ch3f.mol2
- CH3F.smol
- cholesterol.mol
- contour.jvxl
- contourf.jvxl
- createJvxlSurfaces.spt
- cscl.mol2
- cyclohexane_movie.xyz
- d3d.xyz
- d3h.xyz
- d4.xyz
- d4d.xyz
- d4h.xyz
- d5.xyz
- d5f.xyz
- d6.xyz
- d8h.xyz
- d_orbitals_2.jvxl
- diamond.cif
- dickite.cif
- dxy-phase.cube
- dxy.cube
- estrone.jme
- ethanol.xml
- ethene-HOMO.cub.gz
- ethene.jvxl
- ethene.spartan
- f1.in
- f2.in
- fe%28c5h5%292.mgf
- FeBr2.csf
- FeF2.struct
- Formaldehyde.mgf
- full_PBE40.out
- func.jvxl
- functionxy.jvxl
- fxy.jvxl
- fxycontour.jvxl
- gamess-RHF-3-21G.log
- gamess-UHF-3-21G.log
- Gaussian.csf
- gibbs.jvxl
- gold.cif
- gold.spt
- gold3.spt
- groups.scr
- guga.gamess.gz
- H2-OPT.log
- h2o-crude.xyz
- H2O.adf.dgrid
- hb.pdb.gz
- heme.pdb
- hydroxy.struct
- ice.pdb
- icsd_200866.cif
- icsd_250072.cif
- icsd_26520.cif
- ih.xyz
- ir.out
- iso.spt
- iso1.jvxl
- iso10.jvxl
- iso10b.jvxl
- iso11.jvxl
- iso11b.jvxl
- iso12.jvxl
- iso12b.jvxl
- iso13.jvxl
- iso13b.jvxl
- iso14.jvxl
- iso14b.jvxl
- iso1b.jvxl
- iso2.jvxl
- iso2b.jvxl
- iso3.jvxl
- iso3b.jvxl
- iso4.jvxl
- iso4b.jvxl
- iso5.jvxl
- iso5b.jvxl
- iso6.jvxl
- iso6b.jvxl
- iso7.jvxl
- iso7b.jvxl
- iso8.jvxl
- iso8b.jvxl
- iso9.jvxl
- iso9b.jvxl
- isob.spt
- job656_density.mo
- kaolin.mol
- ketone.jme
- kuds0105a.ccdc.cif
- lac_dna1.pdb.gz
- lac_dna1.spt
- lac_dna2.spt
- live3DJmol.pdf
- lta-11%281%29.xyz
- maleic.cif
- mecy.jme
- methanol.csf
- methanol.spartan
- methylacetate.csf
- mgo_slab.out
- minrot.spt
- multi-mo.txt
- multi-surface.txt
- multiProcessTest.txt
- n-butane2.spardir.html
- n-butane_M0001.jxyz
- nacl.cif
- NaCl.mol
- NaCl_iso.png
- nank0104a.ccdc.cif
- nanotour.pdb
- NdZrO.struct
- nepheline.cif
- NiCO3.struct
- Olivine.struct
- orbital%20hibrida%20sp3d.html
- P4O10.mol
- plane.jvxl
- plane1.jvxl
- plane2.jvxl
- planes.jvxl
- pmesh.bin
- PolyBisphenol.xml
- polyhelix.spt
- polymer.out
- pro.spardir.html
- Pyrope.struct
- qtest.cif
- quartz-slab.cif
- quartz.cif
- quartz.mol
- quartz.png
- quartz_111.png
- quartz_packed.png
- quartz_xyz.png
- sample.obj
- sebi0105c.ccdc.cif
- SF6.smol
- SolidNaOH.pdb
- SrTiO3.struct
- SrTiO3t.struct
- star2.gif
- stereo.jme
- STOa.v.xyz
- t.31
- t.37
- t.46
- t.pdb
- t21.adf
- TCBEWREA.mol
- team0104a.ccdc.cif
- test.jme
- test.zip
- test1.spt
- test1.txt
- test1.zip
- test2.spt
- testpmesh.txt
- testscript.spt
- testscript2.spt
- testscripts.spt
- thyroxine.cml
- thyroxinenoh.mol
- Ti2O3.cif
- Ti2O3.struct
- timnav.spt
- TiO.struct
- titanium.cif
- tri.htm
- tri.spt
- trimethylamine.jme
- troilite.cif
- vasprun.xml
- vibs.smol
- Water%21Liquid.xml
- water-AM1.sparchive
- water-G03W.out
- water.xyz
- water19.mo
- water35.mo
- water_pmesh.xyz
- XeF4.smo
- xxxx.pdb
- y1237.cif
- zinc.mol2
- zircon.xyz
- ZNQUKROD.mol
- ZnSO4%21Solution.odydata
Ini di unggah kembali dari pangkalan data di sini.
Beberapa data dalam molekul sebaiknya tidak diaku milik pribadi. Ini hanya untuk pembelajaran belaka.
Jmol dan Pembelajaran Kimia
Potensi besar yang dapat digunakan untuk pembelajaran kimia terdapat dalam Jmol. Jmol dapat digunakan secara daring maupun luring.
Untuk Jmol luring pengguna perlu tahu beberapa perintah yang dapat digunakan dalam Jmol sebab tidak semua perintah tersedia dalam menu utama Jmol.
Perintah-perintah umumnya dapat dijalankan melalui Console. Semua perintah dapat dibaca di sini.
Contoh web aplikasi jmol yang diunggah ke blog ini dari web stolaf dot edu adalah seperti berikut: http://blogchem.com/urip/jmol/jsmol/simple2.htm